PDT2.1をアップデートしました。
http://www.eclipse.org/pdt/downloads/?showAll=1&hlbuild=S200907140646&project=pdt#S200907140646:titleテスト
でPDTの新しいバージョン(2.1.1RC3 (2009/07/14) )がでていましたので
アップデート。eclipseは3.5(Galileo)です。
アップデートしたらPHPの新規プロジェクト作成にエラーがでたりするバグが解消されていました。
手順は以下のとおりです。(http://pdt-tools.sourceforge.jp/feature_patch.htmlを参考にしました。)
1. メニューの「Help」から「新規ソフトウェアのインストール(Install New Software...)」を選択
2. 「追加(Add)」で「アーカイブ(Archive)」を選択し、ダウンロードしたZipファイル
(今回はpdt-Update-2.1.1RC3.zip)を指定→zipファイルをそのまま指定することに注意
3. 認識されたバージョンを選択
4. 「項目をカテゴリー別にグループ化(Group items by category)」と「必須ソフトウェア...(Contact all updates〜)」のチェックを 外す
あとは適当にNEXT